肛门一阵阵疼可能由以下原因引起：
1.肛裂：肛管皮肤全层纵行裂开并形成感染性溃疡，典型表现为肛门疼痛、便秘和出血。肛门视诊可发现肛裂“三联征”，即肛裂、前哨痔和肛乳头肥大。
2.肛周脓肿：肛管、直肠周围软组织内或其周围间隙内发生急性化脓性感染，并形成脓肿，主要表现为肛门疼痛、肿胀和发热。
3.血栓性外痔：肛门缘皮下静脉破裂，血液淤积皮下形成圆形血肿，中医称为“血痔”。主要表现为肛门部肿物、疼痛，肛门检查可发现肛周或肛管皮下有暗紫色肿物，有时伴表面轻度糜烂出血。
4.内痔嵌顿：多因内痔脱出未及时回纳，肛管或直肠下端的内痔脱出，嵌顿于肛门外，致使肛管皮下血管破裂、血栓形成，导致局部组织水肿、坏死。主要表现为肛门疼痛、内痔脱出、便血等。
5.肛窦炎：肛窦炎是指肛窦部的感染性疾病，是肛管直肠炎的常见并发症。主要表现为肛门下坠感、疼痛、肛管分泌物流出等。
6.其他：肛门直肠神经官能症、肛管直肠癌等也可引起肛门疼痛。
如果出现肛门一阵阵疼的症状，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，在日常生活中应注意保持肛门清洁，避免食用辛辣刺激性食物，养成良好的排便习惯。