小孩阴茎肿疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.包茎或包皮过长：包茎是指包皮口狭窄，包皮不能上翻露出阴茎头；包皮过长则是指包皮覆盖阴茎头，但能上翻露出阴茎头。包茎或包皮过长时，包皮垢不易排出，长期刺激阴茎头和包皮，容易引起炎症，导致阴茎肿疼。
2.龟头炎：龟头炎是指龟头黏膜的炎症。可由细菌、真菌、滴虫等感染引起。龟头炎时，龟头会出现红肿、疼痛、糜烂等症状，严重时会累及阴茎。
3.尿道炎：尿道炎是指尿道黏膜的炎症。可由细菌感染引起，也可与龟头炎同时存在。尿道炎时，患儿会出现尿频、尿急、尿痛等症状，尿道口可有脓性分泌物，炎症累及阴茎时，可导致阴茎肿疼。
4.阴茎外伤：阴茎受到外力撞击、挤压、切割等损伤时，会引起阴茎肿疼。
5.过敏：某些过敏体质的小孩，接触到某些过敏原后，会引起阴茎过敏反应，出现肿疼、瘙痒等症状。
6.其他：蚊虫叮咬、寄生虫感染、药物过敏等也可能导致小孩阴茎肿疼。
治疗方法：
1.保持局部清洁：用温水清洗阴茎，避免使用刺激性的清洁剂。
2.抗感染治疗：根据病因选择合适的抗生素或抗真菌药物进行治疗。
3.对症治疗：疼痛明显时，可使用止痛药缓解疼痛。
4.手术治疗：如果是包茎或包皮过长引起的阴茎肿疼，需要进行手术治疗，如包皮环切术。
5.避免刺激：避免摩擦、搔抓阴茎，穿着宽松的内裤。
6.就医诊治：如果阴茎肿疼持续不缓解或加重，或伴有其他症状，如发热、排尿困难等，应及时就医，以便明确病因，进行针对性治疗。
需要注意的是，小孩的生殖器官比较娇嫩，家长应注意保护。如果发现小孩阴茎肿疼，应及时就医，避免自行处理，以免延误病情。