怀孕40多天流血两天，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：怀孕40多天时，孕囊尚不稳定，剧烈运动、性生活、过度劳累等可能导致先兆流产，出现阴道流血。此外，胚胎发育不良、孕妇患有全身性疾病等也可能导致先兆流产。如果流血量较少，没有腹痛等不适，可以卧床休息，观察流血情况。如果流血量较多，伴有腹痛等不适，应及时就医，医生一般会建议进行保胎治疗，如使用黄体酮、HCG等。
2.宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床称为宫外孕，也称异位妊娠。宫外孕时，随着孕囊的生长，会导致输卵管破裂，引起大出血，甚至危及生命。宫外孕的主要表现为停经后阴道流血、腹痛，严重时可出现晕厥、休克。如果怀孕40多天时出现阴道流血，同时伴有一侧下腹部隐痛或酸胀感，应警惕宫外孕的可能，及时就医，进行B超、血HCG等检查，以明确诊断。一旦确诊宫外孕，应尽早治疗，可选择药物保守治疗或手术治疗。
3.葡萄胎：葡萄胎是一种良性滋养细胞疾病，与妊娠相关。停经后阴道流血是葡萄胎的主要症状之一，多为间歇性阴道流血，量多少不定，血液可呈暗红色或鲜红色，还可能排出水泡样组织。如果怀孕40多天时出现阴道流血，应及时就医，进行B超、血HCG等检查，以明确诊断。确诊葡萄胎后，应尽早清宫，术后还需定期复查血HCG，直至恢复正常。
4.其他：宫颈息肉、宫颈癌等也可能导致怀孕40多天时阴道流血。
总之，怀孕40多天流血两天是一种异常情况，需要引起重视。建议及时就医，进行相关检查，明确原因，并在医生的指导下进行治疗。同时，孕妇应注意休息，避免劳累和剧烈运动，保持心情愉快，加强营养，按时产检。