脸上长小疙瘩的原因有很多，以下是一些常见的原因：
1.痤疮：痤疮是一种常见的皮肤病，主要与皮脂腺分泌过多、毛囊皮脂腺导管堵塞、细菌感染和炎症反应等因素有关。痤疮的发生与多种因素有关，如遗传、内分泌、毛囊微生物感染等。痤疮好发于青少年，对青少年的心理和社交影响很大，但青春期后往往能自然减轻或痊愈。
2.粉刺：粉刺是痤疮的一种早期表现，主要由于毛囊皮脂腺开口处角化过度，导致皮脂排泄障碍，形成粉刺。粉刺分为开放性粉刺（黑头粉刺）和闭合性粉刺（白头粉刺）两种。
3.过敏：过敏是一种机体的变态反应，是人对正常物质（过敏原）的一种不正常的反应，当过敏原接触到过敏体质的人群才会发生过敏反应，过敏原有花粉、粉尘、异体蛋白、化学物质、紫外线等几百种。在过敏反应的发生过程中，过敏介质起着直接的作用，过敏原是过敏病症发生的外因，而机体免疫能力低下，大量自由基对肥大细胞和嗜碱粒细胞的氧化破坏是过敏发生的内因。
4.湿疹：湿疹是由多种内外因素引起的瘙痒剧烈的一种皮肤炎症反应。湿疹病因复杂，常为内外因相互作用结果。内因如慢性消化系统疾病、精神紧张、失眠、过度疲劳、情绪变化、内分泌失调、感染、新陈代谢障碍等，外因如生活环境、气候变化、食物等均可影响湿疹的发生。外界刺激如日光、寒冷、干燥、炎热、热水烫洗以及各种动物皮毛、植物、化妆品、肥皂、人造纤维等均可诱发。是复杂的内外因子引起的一种迟发型变态反应。
5.毛囊炎：毛囊炎系由金黄色葡萄球菌感染毛囊引起的炎症。好发于头部、项部、臀部、肛周或身体其他部位，且有复发倾向，常多处发生，性质顽固，迁延难愈。
6.其他原因：脸上长小疙瘩还可能与其他因素有关，如药物过敏、化妆品过敏、蚊虫叮咬、病毒感染等。
总之，脸上长小疙瘩的原因有很多，如果症状持续不缓解或加重，建议及时就医，以便明确诊断并进行针对性治疗。