小阴唇颜色发黑主要与多种因素有关，包括遗传因素、激素水平变化、长期摩擦刺激等。
遗传因素影响
有些人天生小阴唇色素细胞就相对活跃，使得小阴唇颜色较深，这是由遗传基因决定的，从出生起就可能存在这种情况，且不受后天过多因素改变，具有一定的个体差异性。
激素水平变化所致
女性进入青春期后，体内雌激素水平升高，会促使外阴部色素沉着增加，小阴唇颜色逐渐变深，这是正常的生理发育现象，随着年龄增长到一定阶段，这种变化会比较明显，在怀孕、哺乳等特殊生理时期，激素水平大幅波动，也会进一步加重小阴唇的色素沉着。
长期摩擦刺激引发
长期穿着紧身衣物、进行剧烈运动等，会使小阴唇频繁受到摩擦，局部反复受到刺激后，血液循环和代谢等会发生改变，导致色素沉积增多，进而出现颜色发黑的情况，比如经常骑自行车的女性，小阴唇受摩擦机会多，颜色发黑的概率相对较高。
年龄增长因素
随着年龄不断增长，人体的新陈代谢等生理功能会有所变化，外阴部的皮肤黏膜也会逐渐出现色素沉着增加的情况，小阴唇颜色发黑也会随之更明显，这是机体衰老在局部的一种表现。