阴茎系带突然变短且包皮下翻时疼痛，可能与系带过短、包皮龟头炎、系带损伤等有关。具体分析如下：
1.系带过短：如果阴茎系带先天发育异常，或存在过短的情况，在包皮下翻时，系带会受到过度牵拉，从而引起疼痛。
2.包皮龟头炎：包皮龟头炎可导致包皮和龟头黏膜红肿、疼痛，在包皮下翻时，疼痛会更加明显。
3.系带损伤：如果阴茎系带受到外力撞击或过度摩擦，可能会导致系带损伤，从而引起疼痛。
4.其他：包茎、系带挛缩等也可能导致类似症状。
如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因。医生可能会根据具体情况，采取以下治疗措施：
1.系带延长术：如果是系带过短引起的，可以通过手术将系带延长。
2.抗感染治疗：如果是包皮龟头炎引起的，需要使用抗生素进行抗感染治疗。
3.系带修复术：如果是系带损伤引起的，需要进行系带修复术。
4.其他治疗：对于包茎等情况，可能需要进行包皮环切术等治疗。
此外，在治疗期间，应注意保持局部清洁卫生，避免摩擦和刺激，避免性生活。同时，应注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物。如果有其他不适症状，应及时告知医生。