生物病毒无细胞结构，体积微小，需借助电子显微镜观察，其生存依赖活细胞，靠侵入宿主细胞利用宿主细胞物质繁殖；细菌有细胞结构，体积比病毒大，可在外界环境中独立生存繁殖，有多种形态，如球状、杆状、螺旋状等。
形态结构方面
病毒形态多样，有球形、杆形、蝌蚪形等，无细胞结构，主要由核酸和蛋白质外壳组成；细菌有细胞壁、细胞膜、细胞质等基本结构，虽无成形细胞核，但有拟核区域，形态包括球菌、杆菌、螺旋菌等。
生存繁殖方式
病毒必须寄生在活细胞内，利用宿主细胞的代谢系统来复制自身核酸和合成蛋白质外壳，进而组装成新的病毒颗粒；细菌具有相对独立的代谢体系，能在适宜的环境中通过二分裂等方式进行自主繁殖，从周围环境中摄取营养物质来维持生命活动和生长。
对生物体影响
病毒感染可引发多种疾病，如流感病毒引起流感、新冠病毒导致新冠肺炎等，对宿主细胞有较强的选择性和破坏性；细菌感染可引起化脓性炎症、食物中毒等，部分细菌在人体免疫功能低下等情况下会引发感染性疾病，不过也有一些细菌是人体正常菌群的组成部分，对维持人体微生态平衡有重要作用。
检测与防治差异
病毒检测常用核酸检测等方法，防治上抗病毒药物相对有限，疫苗是重要预防手段；细菌检测可通过涂片镜检、细菌培养等，抗生素是治疗细菌感染的主要药物，但需注意抗生素滥用问题，同时可通过讲究卫生等方式预防细菌感染。