乙肝疫苗全程需接种三针，按照0、1、6个月程序，即接种第1针疫苗后，间隔1及6个月注射第2及第3针疫苗。
新生儿接种乙肝疫苗应采用0、1、6个月的接种程序。新生儿的接种部位为大腿前部外侧肌肉，儿童和成人为上臂三角肌中部肌肉注射。单用乙型肝炎疫苗阻断母婴传播的保护率为87.8%。
接种乙肝疫苗的主要原因是预防乙肝病毒感染。乙肝疫苗是一种预防乙型肝炎的疫苗，即从乙型肝炎病毒携带者血浆中分离乙肝表面抗原，经处理后而制成。接种乙肝疫苗后，可刺激免疫系统产生保护性抗体，这种抗体存在于人的体液之中，乙肝病毒一旦出现，抗体会立即作用，将其清除，阻止感染，并不会伤害肝脏，从而使人体具有了预防乙肝的免疫力，从而达到预防乙肝感染的目的。