三个月的婴儿进行体检时，通常会进行以下检查：
一、身体检查
1.测量身高、体重、头围等基本生长指标，评估婴儿的营养状况和生长发育情况。
2.检查身体各个部位，包括头部、颈部、胸部、腹部、四肢等，观察是否有畸形、肿块或其他异常。
3.检查心肺听诊，听心肺是否有杂音或异常呼吸音。
4.检查腹部触诊，了解腹部器官的情况。
5.检查外生殖器，观察是否有异常。
二、神经运动检查
1.检查婴儿的肌张力、反射、姿势等，评估神经运动发育情况。
2.进行握持反射、拥抱反射、踏步反射等神经反射检查。
3.观察婴儿的抬头、翻身、坐立、爬行等运动发育情况。
三、眼部检查
1.检查婴儿的视力，观察是否有斜视、弱视等问题。
2.检查婴儿的眼底，排除先天性眼病。
四、听力检查
1.使用听力筛查工具，如耳声发射或自动听性脑干反应等，进行听力筛查。
2.如果听力筛查未通过，需要进一步进行听力诊断。
五、其他检查
1.根据婴儿的具体情况，可能会进行血常规、尿常规等检查，以了解婴儿的健康状况。
2.医生还会询问婴儿的喂养情况、睡眠情况、大小便情况等，给予家长相应的喂养和护理建议。
需要注意的是，具体的体检项目可能因地区、医院和医生的不同而有所差异。在体检前，家长可以咨询医生，了解详细的体检内容和注意事项。体检结果将为医生提供评估婴儿健康状况的依据，家长可以根据医生的建议，及时采取相应的措施，保障婴儿的健康成长。