耳朵根后面疼的原因比较复杂，可能与感染、外伤、耳部疾病、颈部疾病等有关。以下是一些常见的原因：
1.感染：如耳后淋巴结炎、皮脂腺囊肿感染等，可导致耳朵根后面疼痛。
2.外伤：耳后皮肤损伤、挫伤或撕裂伤等，可引起疼痛。
3.耳部疾病：中耳炎、外耳道炎等耳部疾病也可能引起耳朵根后面疼痛。
4.颈部疾病：颈椎病、颈部肌肉劳损等颈部疾病，疼痛可放射至耳朵根后面。
5.神经痛：如枕大神经痛、耳大神经痛等，可导致耳朵根后面疼痛。
6.其他原因：系统性红斑狼疮、颞下颌关节紊乱等也可能引起耳朵根后面疼痛。
治疗方法因病因而异。如果是感染引起的，需要使用抗生素进行抗感染治疗；如果是外伤导致的，需要进行清创缝合；如果是耳部疾病引起的，需要治疗耳部疾病；如果是颈部疾病引起的，需要治疗颈部疾病；如果是神经痛引起的，需要使用止痛药、营养神经药物等进行治疗。
如果耳朵根后面疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。