肠道功能紊乱性腹泻可能会自愈，也可能不会自愈，具体情况因人而异。
肠道功能紊乱性腹泻的原因较为复杂，可能与饮食、精神、肠道感染等因素有关。如果腹泻症状较轻，患者注意饮食调整，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，同时保持良好的心态，避免过度紧张和焦虑，注意腹部保暖，可能会逐渐自愈。
但是，如果腹泻症状较为严重，或持续时间较长，可能会导致营养不良、脱水等并发症，需要及时就医，在医生的指导下进行治疗。治疗方法包括药物治疗、调整饮食、心理治疗等。
此外，一些患者可能存在肠道器质性病变，如炎症性肠病、肠易激综合征等，这些疾病引起的腹泻通常需要长期治疗，难以自愈。
因此，如果出现肠道功能紊乱性腹泻，建议及时就医，明确病因，在医生的指导下进行治疗。同时，患者应注意饮食卫生，避免食用不洁食物，保持良好的心态，有助于缓解症状。