补牙后会痛通常是由以下原因引起的：
1.龋洞较深：如果龋洞较深，补牙时可能需要垫底或进行牙髓安抚治疗，这些操作可能会刺激牙髓，导致补牙后短期内出现疼痛。
2.垫底材料：垫底材料的刺激也可能引起补牙后疼痛。如果垫底材料选择不当或垫底不严密，可能会刺激牙髓，引起疼痛。
3.牙髓反应：在补牙过程中，如果牙髓受到刺激或感染，可能会引发牙髓炎或根尖周炎，导致补牙后出现疼痛。
4.咬合问题：补牙后，如果咬合关系调整不当，可能会导致牙齿在咀嚼时受力不均，引起疼痛。
5.其他因素：补牙后，口腔内的食物残渣、细菌等可能会刺激补牙材料周围的组织，引起炎症，导致疼痛。此外，补牙后不注意口腔卫生，也可能导致牙龈炎、牙周炎等疾病，引起疼痛。
如果补牙后出现疼痛，应及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。如果疼痛较轻，可以先观察一段时间，避免用患侧咀嚼，避免食用辛辣、刺激性食物，保持口腔清洁。如果疼痛持续加重或伴有其他症状，如牙龈肿胀、牙齿松动等，应及时就医，进行进一步的检查和治疗。