1、牙疼：牛黄甲硝唑胶囊对厌氧菌有较好的抗菌作用，主要用于治疗厌氧菌感染引起的牙疼，如智齿冠周炎、牙髓炎、根尖周炎等。同时，该药物对口腔手术后的厌氧菌感染也有预防作用。
2、牙周炎：牛黄甲硝唑胶囊对牙周炎也有一定的治疗效果。牙周炎是一种侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，多由厌氧菌感染引起。牛黄甲硝唑胶囊可以有效抑制厌氧菌，缓解牙周炎症状。
3、急性智齿冠周炎：当智齿萌出不全或阻生时，牙冠周围软组织发生的炎症称为智齿冠周炎。牛黄甲硝唑胶囊可用于治疗急性智齿冠周炎，缓解疼痛、肿胀等症状。
需要注意的是，对甲硝唑或吡咯类药物过敏患者禁用。有活动性中枢神经疾病和血液病患者禁用。孕妇禁用。饮酒者禁用。使用过程中可能会出现恶心、呕吐、食欲不振等胃肠道反应，一般不影响治疗。如果症状严重或持续不缓解，应及时就医。此外，使用该药物期间及停药3天内，禁止饮酒，避免出现双硫仑样反应。