小便总感觉尿不干净，可能是以下原因导致：
1.泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎等，炎症刺激可导致尿频、尿急、尿不尽。此外，还可能伴有尿痛、尿液混浊等症状。治疗方法主要是使用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，要注意多喝水，促进排尿，有助于病情恢复。
2.前列腺疾病：男性前列腺增生、前列腺炎等疾病，可导致尿道受压、狭窄，从而引起排尿不畅，出现尿不尽的感觉。此外，还可能伴有尿急、尿痛、尿分叉等症状。治疗方法因病因而异，如前列腺增生可使用特拉唑嗪、非那雄胺等药物，前列腺炎则需要使用抗生素、α受体阻滞剂等药物。严重的前列腺疾病可能需要手术治疗。
3.膀胱过度活动症：多见于女性，常由于膀胱逼尿肌不稳定、尿道及盆底肌功能障碍等原因引起。主要表现为尿频、尿急、尿不尽，甚至急迫性尿失禁。治疗方法包括行为训练、药物治疗等，常用药物有托特罗定、索利那新等。
4.其他：如尿道结石、肿瘤等，也可能导致排尿不畅。
如果出现小便总感觉尿不干净的情况，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，在日常生活中，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，有助于预防泌尿系统感染。