霉菌性阴道炎的最好治疗方法是消除诱因，根据患者情况选择局部或全身应用抗真菌药物，并结合局部对症处理。
霉菌性阴道炎是由假丝酵母菌引起的常见外阴阴道炎症，假丝酵母菌是条件致病菌，10%～20%的非孕妇女及30%的孕妇阴道中有此菌寄生，但菌量极少，呈酵母相，并不引起症状。只有当全身及阴道局部免疫能力下降，假丝酵母菌大量繁殖，才会引发阴道炎。以下是具体治疗方法：
1.消除诱因：若有糖尿病应给予积极治疗，及时停用广谱抗生素、雌激素及皮质类固醇激素。勤换内裤，用过的内裤、盆及毛巾均应用开水烫洗。
2.局部用药：以局部短疗程抗真菌药物为主，常用药物有克霉唑栓剂、硝酸咪康唑栓剂、制霉菌素栓剂等。均于每晚睡前洗净外阴后，将栓剂放入阴道深部，连用7日为一疗程。
3.全身用药：对不能耐受局部用药者、未婚妇女及不愿采用局部用药者可选用口服药物。常用药物有氟康唑150mg，顿服；也可选用伊曲康唑200mg，每日1次，连用3～5日；或采用克霉唑150mg，每日1次，连用7日。
需要注意的是，霉菌性阴道炎可通过性生活直接传播，也可通过接触感染的衣物间接传播，故治疗期间应避免性生活，同时性伴侣应进行假丝酵母菌的检查及治疗。此外，霉菌性阴道炎容易复发，因此需遵医嘱完成治疗疗程，并在停药后定期复查，以了解治疗效果及是否复发。