扁平疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的。
HPV是一种常见的病毒，有多种亚型。扁平疣主要由HPV感染皮肤黏膜后在局部增生形成，常见的亚型有HPV3、HPV10等。当人体皮肤或黏膜受损时，HPV可以通过破损处进入皮肤或黏膜细胞内，并在细胞内复制和增殖，导致扁平疣的发生。
扁平疣的治疗方法主要包括外用药物、物理治疗和系统治疗等。
外用药物包括维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏等，可以促进疣体的脱落。物理治疗包括冷冻、激光、电灼等，可以直接破坏疣体。系统治疗主要用于疣体较多或外用药物、物理治疗效果不佳的患者，常用的药物有干扰素、转移因子等。
需要注意的是，扁平疣具有传染性，可通过直接或间接接触传播。在治疗过程中，应避免搔抓疣体，以免造成自身接种传播。同时，注意皮肤清洁卫生，避免与他人共用毛巾、浴巾等物品。如果扁平疣症状严重或治疗不当，可能会留下疤痕或色素沉着。因此，建议及时就医，在医生的指导下进行治疗。