月经结束后三天还有褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.黄体萎缩不全：黄体萎缩不全可能导致子宫内膜脱落不完全，使月经结束后仍有少量出血，表现为褐色分泌物。
2.子宫内膜息肉：子宫内膜息肉是一种常见的妇科病，可能导致月经间期出血、经量增多、经期延长等症状。
3.子宫内膜炎：子宫内膜炎是子宫内膜的炎症，可能引起不规则阴道出血、分泌物异常等症状。
4.其他：子宫肌瘤、子宫腺肌症、内分泌失调等也可能导致类似症状。
需要注意的是，褐色分泌物也可能是其他妇科疾病或全身性疾病的表现，如宫颈癌、血液病等。如果持续出现这种情况，建议及时就医，进行详细的检查，如B超、性激素六项等，以明确原因，并采取相应的治疗措施。
此外，以下是一些建议：
1.保持良好的生活习惯，如规律作息、均衡饮食、适量运动等，有助于维持内分泌的稳定。
2.注意个人卫生，尤其是经期卫生，避免感染。
3.如果有妇科疾病，应积极治疗，以免病情加重。
4.定期进行妇科检查，以便早发现、早治疗。