宝宝发烧39度时，可采取以下方法处理：
1.服用退烧药：宝宝发烧39度属于高烧，需要及时服用退烧药，如布洛芬或对乙酰氨基酚等。同时，要注意按照药品说明书的剂量和使用方法给宝宝服用，不要超量服用。
2.物理降温：除了服用退烧药外，还可以采用物理降温的方法，如给宝宝洗温水澡、用温水擦拭手心、脚心、腋窝等部位，或使用退热贴等。
3.多喝水：发烧会导致宝宝体内水分流失，因此要及时给宝宝补充水分，让宝宝多喝水或饮用适量的果汁、盐水等。
4.保持室内通风：保持室内空气流通，可降低室内温度，缓解宝宝的不适症状。
5.观察宝宝的情况：在处理宝宝发烧的过程中，要密切观察宝宝的情况，如体温变化、精神状态、呼吸情况等。如果宝宝出现高热惊厥、呼吸急促、精神萎靡等异常情况，应及时就医。
6.就医治疗：如果宝宝发烧持续时间较长或体温较高，或出现其他异常症状，应及时就医，以便明确病因，并进行针对性的治疗。
需要注意的是，以上方法仅供参考，如果宝宝发烧情况较为严重或持续时间较长，建议及时就医。同时，在处理宝宝发烧的过程中，要注意保持宝宝的舒适和安全，避免使用过于厚重的衣物或包裹过严，以免影响宝宝的散热。