小脚趾边长茧很痛，可能是鸡眼、胼胝、跖疣等疾病引起，也可能是长期摩擦、挤压等导致。以下是一些建议：
1.就医检查：如果小脚趾边长茧伴有疼痛，建议及时就医，进行相关检查，如皮肤镜检查、病理活检等，以明确病因。
2.治疗病因：根据检查结果，医生会制定相应的治疗方案。如果是鸡眼或胼胝，可以通过手术、激光、冷冻等方法去除；如果是跖疣，则需要进行抗病毒治疗。
3.注意护理：在治疗的同时，需要注意小脚趾的护理，避免长时间行走或站立，穿着舒适的鞋子，避免摩擦和挤压。
4.预防复发：治疗后需要注意预防复发，保持脚部清洁干燥，避免长时间泡水，定期修剪指甲等。
总之，如果小脚趾边长茧伴有疼痛，建议及时就医，明确病因，并进行相应的治疗。同时，需要注意护理和预防复发。