胎停即胚胎停止发育，多种因素可导致，如胚胎染色体异常是最常见原因，约占50%-60%；母体因素包括内分泌异常，如黄体功能不全等，会影响孕激素分泌，不利于胚胎着床发育；子宫解剖异常，如子宫畸形等，会使子宫环境不利于胚胎生长；感染因素，孕期感染某些病毒等，也可能引发胎停；还有不良生活方式，如吸烟、酗酒等，会增加胎停风险。
胚胎染色体异常
胚胎染色体异常是早期胎停的重要原因，父母生殖细胞在形成过程中染色体发生畸变，或受精过程中染色体组合异常，导致胚胎染色体数目或结构异常，无法正常发育，这种情况难以预防，发生一次后下次怀孕仍有一定概率出现。
母体内分泌异常
黄体功能不全时，黄体分泌的孕激素不足，不能为胚胎着床和发育提供良好的内分泌环境，影响胚胎种植及发育。甲状腺功能异常，无论是甲亢还是甲减，都会干扰母体的代谢及激素平衡，进而影响胚胎发育，孕妇若有甲状腺疾病史需在孕前及孕期密切监测甲状腺功能。
子宫解剖异常
子宫畸形如纵隔子宫等，会使子宫宫腔形态异常，胚胎着床后空间受限，影响胚胎的血供及生长空间。子宫肌瘤尤其是黏膜下子宫肌瘤，会占据宫腔空间，改变宫腔内环境，阻碍胚胎发育，有子宫解剖异常情况的孕妇需在孕前评估并根据情况处理。
感染因素
孕期感染风疹病毒、巨细胞病毒等，这些病毒可通过胎盘影响胚胎，干扰胚胎的正常细胞分裂、分化等过程，导致胚胎停止发育。孕妇在孕期应注意避免接触感染源，预防感染。
不良生活方式
吸烟会使尼古丁等有害物质进入母体血液循环，影响胎盘的血流灌注，减少胚胎的氧气和营养供应。酗酒会损害胚胎的细胞结构和功能，增加胎停的发生几率，备孕期及孕期应杜绝吸烟酗酒等不良生活方式。