三周岁儿童需要自费接种的疫苗有：
1.流感疫苗：可预防流感病毒感染，特别是对于儿童、老年人和患有基础疾病的人群，接种流感疫苗可以有效降低感染流感的风险，并减少并发症的发生。流感疫苗通常在每年的秋季接种。
2.手足口病疫苗：手足口病是由肠道病毒引起的传染病，主要通过密切接触传播。手足口病疫苗可以预防肠道病毒71型（EV71）感染，EV71型感染是手足口病中较为严重的类型，可引起手足口病、疱疹性咽峡炎等疾病，甚至导致死亡。手足口病疫苗通常在12月龄至24月龄之间接种，基础免疫2剂次，间隔1个月。
3.水痘疫苗：水痘是由水痘带状疱疹病毒引起的急性传染病，主要通过飞沫传播。水痘疫苗可以预防水痘的发生，对于未感染过水痘或未接种过水痘疫苗的人群，接种水痘疫苗是非常重要的。水痘疫苗通常在12月龄至18月龄之间接种，基础免疫2剂次，间隔至少3个月。