早晨睡觉醒来头疼，可能与以下因素有关。
1.睡眠环境：
枕头高度不适：枕头过高或过低，可能会影响颈椎的生理曲度，导致颈部肌肉紧张，进而引起头疼。
卧室温度不适：卧室温度过高或过低，或者空气不流通，可能会影响睡眠质量，导致头疼。
噪音干扰：噪音过大可能会影响睡眠，导致头疼。
2.睡眠习惯：
睡眠时间不足或过长：睡眠时间不足或过长，可能会导致大脑疲劳，引起头疼。
睡前过度兴奋或紧张：睡前过度兴奋或紧张，可能会导致大脑皮层兴奋，影响睡眠质量，引起头疼。
仰卧睡觉：仰卧睡觉可能会导致舌根后坠，阻塞气道，引起呼吸不畅，进而导致头疼。
3.疾病因素：
高血压：血压升高可能会导致头疼。
颈椎病：颈椎病变可能会刺激或压迫椎动脉，导致椎动脉供血不足，从而引起头疼。
偏头痛：偏头痛是一种常见的原发性头痛，可能与遗传、内分泌、饮食、精神等因素有关。
其他：脑炎、脑膜炎、脑肿瘤等疾病也可能会引起头疼。
如果早晨睡觉醒来头疼，建议调整睡眠环境，改善睡眠习惯。如果头疼持续不缓解，或者伴有其他症状，如恶心、呕吐、视力模糊等，建议及时就医，明确病因，并进行针对性治疗。