脖子两侧疼的原因有很多，常见的原因包括：
1.颈部肌肉劳损：长期低头、伏案工作或保持同一姿势，可导致颈部肌肉紧张、痉挛，引起疼痛。
2.颈椎疾病：颈椎间盘突出、骨质增生等颈椎疾病可压迫颈部神经根或椎动脉，引起脖子两侧疼痛，还可伴有上肢麻木、无力等症状。
3.颈部外伤：颈部受到外力撞击、扭伤或拉伤，可导致颈部肌肉、韧带损伤，引起疼痛。
4.感染：颈部淋巴结炎、扁桃体炎等感染性疾病可引起颈部疼痛。
5.其他：系统性红斑狼疮、强直性脊柱炎等自身免疫性疾病，也可累及颈部关节和肌肉，导致疼痛。
如果脖子两侧疼的症状持续不缓解或伴有其他症状，如上肢麻木、无力、头晕、头痛等，应及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。