女性肚脐眼发臭的原因主要有以下几种：
1.细菌感染：肚脐眼是一个比较隐蔽的部位，容易藏污纳垢，如果平时不注意清洁，就会导致细菌滋生，引起感染，从而出现肚脐眼发臭的情况。
2.湿疹：如果肚脐眼周围的皮肤长期处于潮湿、多汗的状态，就容易引起湿疹，导致肚脐眼发臭。
3.脐尿管瘘：这是一种先天性疾病，由于脐尿管未完全闭合，导致尿液从肚脐眼流出，长期刺激肚脐眼周围的皮肤，引起感染和发臭。
4.其他：如寄生虫感染、恶性肿瘤等，也可能导致肚脐眼发臭。
如果女性出现肚脐眼发臭的情况，建议及时就医，明确病因，并进行针对性的治疗。同时，要注意保持肚脐眼的清洁干燥，避免搔抓和刺激。在治疗期间，应避免食用辛辣、刺激性食物，以免加重病情。