长期佩戴美瞳可能会导致眼睛疼痛，这可能是由以下原因引起的：
1.角膜缺氧：美瞳会阻挡部分氧气进入角膜，导致角膜缺氧。长时间缺氧会引起角膜水肿、上皮细胞受损，从而导致眼睛疼痛。
2.感染：如果美瞳护理不当，如不及时清洁、消毒，可能会滋生细菌、真菌等病原体，引起角膜炎、结膜炎等感染，导致眼睛疼痛、红肿、分泌物增多等症状。
3.过敏：部分人对美瞳的材料或护理液中的成分过敏，可能会引起眼部过敏反应，导致眼睛疼痛、红肿、瘙痒等症状。
4.其他因素：佩戴不合适的美瞳、佩戴时间过长、眼部干燥、环境因素等也可能导致眼睛疼痛。
如果佩戴美瞳后出现眼睛疼痛，应立即停止佩戴，并及时就医。医生会进行详细的眼部检查，确定疼痛的原因，并给予相应的治疗。同时，应注意以下几点：
1.选择质量合格的美瞳，并严格按照说明书进行护理和佩戴。
2.避免长时间佩戴美瞳，建议每天佩戴时间不超过8小时。
3.保持眼部清洁，勤洗手，避免用手揉眼睛。
4.如果出现眼部不适，应及时就医，避免自行使用眼药水等药物，以免加重病情。
5.在医生的指导下使用眼药水或其他治疗方法。
总之，佩戴美瞳时应注意眼部卫生和护理，如有不适及时就医。如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，应及时就医，以免延误病情。