怀孕36周肚子疼可能是生理性原因，也可能是病理性原因。生理性原因包括：
1.子宫增大：怀孕后子宫逐渐增大，可能会牵拉子宫周围的韧带，引起肚子疼。
2.假性宫缩：孕晚期可能会出现假性宫缩，表现为肚子发紧、发硬，伴有轻微的疼痛。
3.胎儿入盆：胎儿入盆后，可能会压迫腹部，引起肚子疼。
病理性原因包括：
1.早产：如果肚子疼伴有阴道流血、破水等症状，可能是早产的征兆。
2.胎盘早剥：胎盘早剥是妊娠期的严重并发症，可能会导致肚子疼、阴道流血等症状。
3.其他：妊娠期高血压疾病、妊娠期糖尿病、胎儿宫内窘迫等也可能会引起肚子疼。
如果怀孕36周肚子疼，需要注意观察疼痛的性质、持续时间、有无其他症状，并及时就医，进行相关检查，以明确原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇要注意休息，避免过度劳累，避免剧烈运动，保持心情愉悦，定期产检。