儿童指甲凹凸不平，可能是由以下原因引起：
1.营养不良：如果儿童饮食不均衡，缺乏某些营养素，如蛋白质、维生素、矿物质等，可能导致指甲营养不良，出现凹凸不平的情况。
2.甲癣：由皮肤癣菌感染引起，常侵犯甲板和甲下组织，导致指甲变形、增厚、变色、凹凸不平等。
3.扁平苔藓：一种皮肤黏膜慢性炎症性疾病，可累及指甲，导致指甲出现纵嵴、凹陷、变形等改变。
4.银屑病：俗称牛皮癣，可累及指甲，导致指甲出现凹陷、增厚、变色、分离等改变。
5.湿疹：一种常见的皮肤炎症性疾病，可累及指甲，导致指甲出现纵嵴、凹陷、变形等改变。
6.其他：外伤、感染、系统性疾病等也可能导致儿童指甲凹凸不平。
如果发现儿童指甲凹凸不平，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持儿童的营养均衡，避免接触刺激性物质，注意个人卫生。