囊肿通常不会自行消失。囊肿是一种良性病变，其形成原因可能与感染、损伤、炎症等因素有关。如果囊肿较小且没有引起任何症状，通常不需要治疗，只需定期进行复查，观察囊肿的大小和形态变化。但如果囊肿较大或引起了明显的症状，如疼痛、压迫感、出血等，通常需要进行治疗。治疗方法包括手术切除、抽吸囊液、注射硬化剂等。
需要注意的是，有些囊肿可能会复发或恶变，因此在治疗后仍需定期进行复查。此外，对于一些特定类型的囊肿，如卵巢囊肿、胰腺囊肿等，需要密切关注其变化情况，以便及时发现并处理可能出现的问题。
总之，囊肿是否会自行消失取决于囊肿的类型、大小、位置以及患者的具体情况。如果发现有囊肿，应及时就医，医生会根据具体情况制定相应的治疗方案。