新生儿脑囊肿是否有后遗症，取决于囊肿的部位、大小、性质等因素，可能会出现癫痫、运动和语言发育迟缓、脑积水等后遗症。
1.癫痫：如果脑囊肿位于大脑皮层，可能会刺激大脑神经元异常放电，导致癫痫发作。
2.运动和语言发育迟缓：脑囊肿可能会影响大脑的正常发育，导致新生儿的运动和语言发育迟缓。
3.脑积水：脑囊肿可能会阻塞脑脊液的循环通路，导致脑积水，从而影响大脑的正常发育。
需要注意的是，并不是所有的新生儿脑囊肿都会出现后遗症，而且即使出现了后遗症，也可以通过积极的治疗和康复训练来改善症状。如果家长发现新生儿有脑囊肿，应及时带其到医院就诊，医生会根据具体情况制定治疗方案。