目前常见的新型冠状病毒核酸检测原理主要有两种：逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）和恒温扩增实时荧光检测。
逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）的原理是：以病毒RNA为模板，在逆转录酶的作用下合成互补的cDNA，然后以cDNA为模板进行聚合酶链式反应（PCR）扩增，从而检测出病毒核酸。
恒温扩增实时荧光检测的原理是：在恒温条件下，利用特异性引物和探针，通过核酸扩增和荧光信号检测，实现对病毒核酸的检测。
这两种方法都具有高灵敏度和特异性，可以检测出低浓度的病毒核酸，为新型冠状病毒的诊断提供重要依据。