转氨酶高的用药需根据具体病因决定，不同病因所用药物不同。
一、病毒性肝炎导致的转氨酶高
若由病毒性肝炎引起，如乙肝，可能会用到恩替卡韦等抗病毒药物，但具体用药需医生根据病情判断，抗病毒药物能抑制病毒复制，从根源上改善转氨酶高的状况。但孕妇、儿童等特殊人群使用需格外谨慎，孕妇使用可能影响胎儿，儿童使用要严格遵循儿童用药规范。
二、药物性肝损伤引起的转氨酶高
若是药物性肝损伤导致转氨酶高，首先要停用可疑药物，必要时可能会使用复方甘草酸苷等保肝降酶药物，帮助修复肝细胞损伤，降低转氨酶。但有严重低钾血症、高钠血症等情况的患者使用复方甘草酸苷需权衡利弊，因为它可能会引起水钠潴留等问题。
三、脂肪肝引发的转氨酶高
对于脂肪肝导致的转氨酶高，主要是通过生活方式干预，如调整饮食结构，减少高脂肪、高糖食物摄入，增加运动等。如果伴有代谢综合征，可能会涉及一些调节代谢的药物，但一般先以非药物干预为主，特殊人群如患有糖尿病的脂肪肝患者在用药时要注意药物对血糖等指标的影响。
四、酒精性肝病造成的转氨酶高
酒精性肝病引起的转氨酶高，首要的是戒酒，同时可使用多烯磷脂酰胆碱等药物保护肝细胞。但酒精性肝病患者往往伴有营养不良等情况，在用药时要考虑营养补充等综合因素，孕妇及对本品过敏者禁用多烯磷脂酰胆碱。