治疗毛囊炎最好的方法是根据具体情况采取综合治疗，包括一般治疗、外用药物、系统药物治疗、物理治疗等。以下是具体介绍：
1.一般治疗：保持皮肤清洁，避免搔抓、摩擦等刺激，同时注意饮食清淡，避免食用辛辣、油腻等食物。
2.外用药物：根据病情轻重选择合适的外用药物，如莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等抗生素软膏，或酮康唑乳膏、益康唑乳膏等抗真菌药物。此外，还可以使用含有硫磺、水杨酸等成分的药物，具有清洁、杀菌、抑制皮脂分泌等作用。
3.系统药物治疗：对于病情较重或外用药物治疗效果不佳的患者，可以口服抗生素或抗真菌药物进行系统治疗。常用的抗生素有头孢呋辛酯、阿莫西林等；抗真菌药物有伊曲康唑、氟康唑等。在使用系统药物治疗时，需要注意药物的副作用和禁忌症，并按照医生的建议使用。
4.物理治疗：对于反复发作或慢性毛囊炎患者，物理治疗可能有一定的帮助，如紫外线照射、超短波治疗等。这些治疗方法可以促进炎症消退，缓解症状。
需要注意的是，毛囊炎的治疗方法应根据具体病情而定，在医生的指导下选择合适的治疗方案。同时，患者应注意个人卫生，保持皮肤清洁，避免感染加重病情。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医，以免延误治疗。