女宝宝小便处两侧发红且总哭闹，可能是以下原因导致的：
1.尿布疹：如果宝宝的尿布更换不及时，尿液长时间刺激皮肤，就容易引起尿布疹，导致小便处发红、疼痛，宝宝会因此哭闹。
2.感染：细菌、病毒或真菌等感染都可能引起宝宝的尿道口或阴道口发红、肿胀、疼痛，导致宝宝哭闹。
3.过敏：宝宝接触到某些过敏原，如尿液中的化学物质、纸尿裤中的化学成分、某些食物等，也可能引起过敏反应，导致小便处发红、瘙痒、疼痛。
4.外阴炎或阴道炎：如果宝宝的外阴部没有清洁干净，或者有细菌、病毒感染，就可能引起外阴炎或阴道炎，导致小便处发红、疼痛、哭闹。
针对以上原因，可以采取以下措施：
1.保持宝宝的外阴部清洁干燥，及时更换尿布，每天用温水清洗外阴部。
2.选择柔软、透气的纸尿裤，并及时更换。
3.避免宝宝长时间使用尿布，让宝宝的臀部暴露在空气中。
4.如果宝宝的尿布疹严重，可以使用含有氧化锌的护臀霜或医生开具的药膏。
5.给宝宝多喝水，促进尿液排泄，减少尿液对皮肤的刺激。
6.如果宝宝的症状持续不缓解或加重，或者出现发热、排尿困难等症状，应及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。
需要注意的是，在处理宝宝的小便处问题时，要注意保持手部清洁，避免交叉感染。如果宝宝对某种食物或物质过敏，应避免接触。同时，要注意观察宝宝的症状变化，如有异常应及时就医。