怀孕两个月不可以用药流产，怀孕49天内可以药流。怀孕两个月时孕囊较大，药流容易出现药流不全，还需要进行清宫手术，对身体造成二次伤害。
药流是通过药物而非手术终止早孕的一种避孕失败的补救措施。一般用于终止49日以内的妊娠，即怀孕时间不超过7周的早期妊娠。应用药物使妊娠终止，药流虽是一种较安全的方法，但有一定的风险，有药流不全的可能，还可能出现以下副作用：
1.不全流产：药流后出血时间较长，长时间的阴道出血为细菌滋生提供了温床，而由于药流后宫颈内口也处于松弛状态，细菌容易上行感染宫腔，从而引起宫腔感染，严重时还会导致胎膜组织残留，需要进行清宫手术。
2.药流失败：药流后未见胎囊排出，B超证实宫腔内仅为残留物而刮官或已见胎囊排出，但阴道仍有较多出血，持续时间较长，这都有可能是药流失败。
3.月经失调：抗孕药物可以抑制卵巢的功能，影响卵泡的生长发育甚至排卵。个别女性药流后，可发生月经失调，表现为月经周期缩短或延长，月经量增多。
4.影响今后的受孕：药流易导致输卵管堵塞、宫颈粘连等，从而引起不孕症。药流不干净，清宫手术不当，也有可能会影响今后的受孕。
因此，药流需要在医生的指导下进行，并且药流前需要进行全面的身体检查，包括B超、血常规、白带常规等，以确保药流的安全性。如果怀孕两个月，建议及时就医，根据医生的建议选择合适的终止妊娠的方法。