如果婴儿出现消化不良，可以在医生的指导下使用以下药物进行治疗：
1.益生菌：益生菌可以帮助调节肠道菌群，改善消化不良的症状。常用的益生菌有双歧杆菌三联活菌散、枯草杆菌二联活菌颗粒等。
2.消化酶：如果婴儿消化不良是由于缺乏某些消化酶引起的，可以使用消化酶进行治疗。常用的消化酶有胃蛋白酶散、胰酶肠溶胶囊等。
3.中成药：一些中成药也可以用于治疗婴儿消化不良，如小儿消食片、健儿消食口服液等。这些药物具有消食化积、健脾开胃的作用。
需要注意的是，在给婴儿使用药物治疗消化不良时，应该遵循医生的建议，按照剂量和使用方法进行服用。同时，还应该注意调整婴儿的饮食，避免过度喂养，给婴儿提供易消化的食物。如果婴儿的消化不良症状持续不缓解或者出现其他异常症状，应该及时就医。