男性尿道疼痛、小便刺痛可能是尿道炎、前列腺炎、尿路结石等原因引起的，治疗方法主要包括以下几个方面：
1.对因治疗：
尿道炎：可使用抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。
前列腺炎：可使用抗生素、α受体阻滞剂、非甾体抗炎镇痛药等进行治疗，如左氧氟沙星、坦索罗辛、塞来昔布等。
尿路结石：较小的结石可通过多喝水、多运动自行排出，较大的结石则需要进行体外冲击波碎石或手术取石。
2.对症治疗：
疼痛明显者可使用布洛芬、双氯芬酸钠等药物缓解疼痛。
尿频、尿急者可使用托特罗定、索利那新等药物缓解症状。
3.其他治疗：
物理治疗：如微波、射频、激光等，可促进炎症吸收，缓解疼痛。
中医治疗：可使用中药灌肠、针灸等方法进行治疗。
需要注意的是，引起男性尿道疼痛、小便刺痛的原因较多，治疗方法也不同。因此，在出现尿道疼痛、小便刺痛等症状时，应及时就医，明确病因后进行针对性治疗。同时，在治疗期间应注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，避免食用辛辣刺激性食物。