男士尿的时候疼可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因和解决办法：
1.尿路感染：如尿道炎、膀胱炎等，通常还会伴有尿频、尿急等症状。可遵医嘱使用抗生素进行治疗，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星等。
2.前列腺炎：多见于中青年男性，可出现尿频、尿急、尿痛，排尿时尿道不适或灼热，还可能伴有会阴部、耻骨上区、腹股沟区等部位的疼痛。可遵医嘱使用α-受体阻滞剂、抗生素等药物进行治疗，如特拉唑嗪、多西环素等。
3.前列腺增生：多见于老年男性，可出现尿频、尿急、尿不尽、排尿困难等症状，严重时可能会出现尿潴留。可遵医嘱使用α-受体阻滞剂、5-α还原酶抑制剂等药物进行治疗，如坦索罗辛、非那雄胺等。
4.泌尿系统结石：如肾结石、输尿管结石等，可导致排尿疼痛，还可能伴有血尿、恶心、呕吐等症状。较小的结石可以通过多喝水、多运动等方式自行排出，较大的结石则需要进行体外冲击波碎石或手术治疗。
5.其他：如尿道口炎、膀胱癌等也可能导致排尿疼痛。
如果男士出现尿的时候疼的症状，建议及时就医，明确原因后进行针对性治疗。同时，要注意个人卫生，多喝水，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。