怀孕六周肚子疼不正常，可能是先兆流产、宫外孕或其他原因引起。需要及时就医，通过血HCG、孕酮、B超等检查明确原因，并采取相应的治疗措施。
怀孕六周时，孕囊较小，一般不会引起明显腹痛。如果出现肚子疼，可能是以下原因导致：
1.先兆流产：由于胚胎染色体异常、孕妇内分泌失调、免疫功能异常等原因，可能导致先兆流产，出现下腹疼痛或腰骶部疼痛，并伴有阴道少量流血。
2.宫外孕：受精卵在子宫体腔以外着床称为宫外孕，以输卵管妊娠最常见。宫外孕时，由于孕囊逐渐增大，可能导致输卵管破裂，引起剧烈腹痛，甚至出现休克。
3.其他：怀孕六周时，子宫逐渐增大，可能牵拉子宫圆韧带，引起下腹牵扯样疼痛，一般疼痛比较轻微，休息后可以缓解。此外，胃肠道疾病、腹部受凉等也可能导致肚子疼。
如果怀孕六周时出现肚子疼，建议及时就医，进行相关检查，如血HCG、孕酮、B超等，以明确原因。如果是先兆流产，需要卧床休息，使用黄体酮、地屈孕酮等药物进行保胎治疗。如果是宫外孕，需要根据具体情况，选择药物保守治疗或手术治疗。如果是其他原因引起的肚子疼，需要在医生的指导下进行治疗。
总之，怀孕六周肚子疼需要引起重视，及时就医，明确原因，并采取相应的治疗措施，以保障孕妇和胎儿的安全。