孕囊流出后肚子可能还会疼，但通常会逐渐减轻。这是因为孕囊排出后，子宫需要收缩以恢复到正常大小，这个过程中可能会引起疼痛。
孕囊排出后肚子疼的原因主要有以下几点：
1.子宫收缩：孕囊排出后，子宫会通过收缩来止血和恢复到正常大小。这种收缩会引起疼痛，类似于痛经。
2.蜕膜排出：孕囊排出后，子宫内的蜕膜组织也需要排出体外，这也可能导致肚子疼。
3.感染：如果孕囊排出过程中或排出后发生了感染，也会引起肚子疼。
需要注意的是，如果孕囊排出后肚子疼持续时间较长、疼痛程度较重、伴有大量出血或发热等异常症状，应及时就医，以排除其他潜在的问题。
此外，孕囊排出后，女性需要注意休息，避免劳累和剧烈运动，同时要注意个人卫生，保持外阴清洁。饮食上应注意加强营养，多吃一些富含蛋白质、维生素和铁质的食物，以促进身体恢复。
总之，孕囊流出后肚子可能还会疼一段时间，但通常会逐渐减轻。如果疼痛持续时间较长或伴有其他异常症状，应及时就医。同时，女性在药流后应注意休息和个人卫生，以促进身体恢复。