药流40天试纸测出一深一浅两道杠，可能是以下原因。
1.药流不全：药流后，孕囊虽然已经排出，但子宫内可能还残留有胎盘组织或蜕膜组织，导致人绒毛膜促性腺激素（hCG）水平尚未降至正常，所以试纸会测出弱阳性。
2.再次怀孕：药流后，女性的卵巢功能会在22天左右恢复排卵，如果在此期间没有采取避孕措施，就有可能再次怀孕。
3.宫外孕：宫外孕时，胚胎着床在子宫以外的部位，hCG水平较低，所以用试纸检测可能呈弱阳性。
4.滋养细胞疾病：如葡萄胎、绒癌等，也会导致hCG水平升高，试纸测出弱阳性。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要到医院进行详细的检查，如B超、血hCG测定等，以明确诊断。如果是药流不全或宫外孕，需要及时进行治疗，以免延误病情。