两个月宝宝咳嗽有痰是否会自愈，需要根据具体情况来判断。一般来说，如果宝宝咳嗽有痰的症状较轻，没有其他不适，可能会自愈。但如果症状持续加重，或伴有其他异常症状，如发热、呼吸急促、喘息等，可能需要就医治疗。以下是一些可能影响宝宝咳嗽有痰自愈的因素：
1.宝宝自身免疫力：两个月大的宝宝免疫系统尚未完全发育成熟，自身免疫力相对较弱。如果宝宝能够通过自身的免疫力抵抗病原体，咳嗽有痰的症状可能会逐渐减轻并自愈。
2.病因：咳嗽有痰的原因有很多，如感染（病毒、细菌等）、过敏、异物吸入等。如果病因能够被消除，咳嗽有痰也可能会自愈。例如，病毒感染引起的咳嗽通常会在一周左右自愈，而细菌感染可能需要使用抗生素治疗。
3.护理措施：适当的护理措施可以帮助宝宝缓解咳嗽有痰的症状，促进恢复。例如，保持室内空气湿润、多喝水、拍背促进痰液排出等。
4.宝宝的健康状况：如果宝宝本身患有其他疾病，如先天性心脏病、肺部疾病等，咳嗽有痰可能会影响其健康，需要及时就医治疗。
需要注意的是，虽然宝宝咳嗽有痰可能会自愈，但家长也不能掉以轻心。在观察宝宝症状的同时，应注意以下几点：
1.密切观察宝宝的病情变化，包括咳嗽的频率、痰的颜色和质地、呼吸情况等。
2.确保宝宝摄入足够的水分，以保持呼吸道湿润。
3.保持室内空气清新，避免烟雾等刺激物。
4.按照医生的建议进行护理和治疗，如果症状加重或持续时间较长，应及时就医。
总之，两个月宝宝咳嗽有痰是否会自愈，需要综合考虑多种因素。家长应该密切观察宝宝的病情，采取适当的护理措施，并在需要时及时就医。