甲状腺问题的成因较为复杂，可能与遗传因素、自身免疫异常、碘摄入异常、环境因素以及年龄、性别等有关。比如遗传易感性使部分人更易患上甲状腺相关疾病；自身免疫紊乱时，免疫系统错误攻击甲状腺组织可引发甲状腺炎等问题；碘摄入过多或过少也会影响甲状腺正常功能。
遗传因素影响
某些甲状腺疾病具有遗传倾向，若家族中有甲状腺疾病患者，个体患相关甲状腺问题的风险可能增加。比如家族性甲状腺髓样癌与特定基因突变相关，有家族史者需密切关注甲状腺状况。
自身免疫异常引发
自身免疫性甲状腺疾病较为常见，像格雷夫斯病是自身抗体刺激甲状腺过度分泌甲状腺激素，慢性淋巴细胞性甲状腺炎则是自身抗体攻击甲状腺组织导致甲状腺功能减退等。自身免疫异常可能因机体免疫调节功能紊乱而起。
碘摄入异常导致
碘是合成甲状腺激素的重要原料，碘摄入不足会引起甲状腺肿大等问题，而碘摄入过多也可能诱发甲状腺功能异常。例如，在碘缺乏地区人群易患地方性甲状腺肿，而长期高碘饮食地区人群甲状腺疾病发生率可能升高。
环境与其他因素
长期暴露于某些辐射环境下可能影响甲状腺；年龄方面，老年人甲状腺功能可能出现生理性减退，女性在孕期、哺乳期等特殊生理时期甲状腺负担加重，也易出现甲状腺相关问题。