肚脐眼内部疼痛可能由多种原因引起，以下是一些常见的原因：
1.肚脐眼感染：肚脐眼是一个容易藏污纳垢的地方，若不注意清洁，容易导致细菌感染。感染后，肚脐眼周围会出现红肿、疼痛、渗液等症状。
2.肚脐眼损伤：肚脐眼周围的皮肤比较薄，容易受到损伤。如果肚脐眼受到外力撞击、划伤或摩擦等，可能会导致皮肤破损、出血和疼痛。
3.肚脐眼炎症：肚脐眼炎是指肚脐眼及其周围组织的炎症，可能由细菌、病毒或真菌感染引起。除了疼痛外，还可能伴有红肿、渗液、异味等症状。
4.腹部疾病：某些腹部疾病也可能导致肚脐眼内部疼痛，如胃炎、胃溃疡、肠炎、肠梗阻等。这些疾病通常还会伴有其他症状，如恶心、呕吐、腹泻、腹胀等。
5.腹部肌肉拉伤：剧烈运动或不当的腹部运动可能导致腹部肌肉拉伤，从而引起肚脐眼内部疼痛。
6.其他原因：肚脐眼内部疼痛还可能与其他因素有关，如腹部肿瘤、疝气、神经痛等。
如果肚脐眼内部疼痛持续时间较长、疼痛程度较严重或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行详细的检查和诊断，以便确定病因并采取相应的治疗措施。在就医前，应避免自行用手搔抓或抠挖肚脐眼，以免加重感染。同时，保持肚脐眼周围的清洁干燥，避免穿紧身衣物和摩擦肚脐眼。