耳后根疼的原因有很多，比较常见的有以下几种：
1.感染：如外耳道炎、乳突炎等，可导致耳后根疼痛，常伴有耳部红肿、流脓等症状。
2.外伤：如耳部受到撞击、挤压等，可导致耳后根软组织损伤，引起疼痛。
3.神经痛：如耳大神经痛、枕小神经痛等，可引起耳后根放射性疼痛。
4.颈椎病：颈椎间盘突出、颈椎骨质增生等可压迫颈部神经，导致耳后根疼痛，同时可伴有颈部疼痛、上肢麻木等症状。
5.其他：如颞下颌关节紊乱综合征、中耳炎、胆脂瘤型中耳炎等，也可引起耳后根疼痛。
针对不同原因引起的耳后根疼，治疗方法也有所不同。如果是感染引起的，需要使用抗生素进行抗感染治疗；如果是外伤导致的，需要注意休息，避免耳部受到刺激；如果是神经痛引起的，可以使用营养神经、止痛等药物进行治疗；如果是颈椎病引起的，需要进行颈部牵引、理疗等治疗；如果是其他原因引起的，需要针对病因进行治疗。
总之，引起耳后根疼的原因较多，如果疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。