新生儿使用头孢菌素类药物可能会出现以下副作用：
1.过敏反应：这是最常见的副作用之一，表现为皮疹、瘙痒、呼吸困难等。严重的过敏反应可能会导致过敏性休克，危及生命。
2.胃肠道反应：如恶心、呕吐、腹泻等。
3.肝功能损害：少数情况下可能会导致谷丙转氨酶（ALT）、谷草转氨酶（AST）升高。
4.肾功能损害：极少数情况下可能会导致血肌酐、尿素氮升高。
5.菌群失调：长期或大量使用头孢菌素类药物可能会导致肠道菌群失调，引起念珠菌感染等。
6.其他：偶见头痛、发热、注射部位疼痛等。
需要注意的是，并非所有新生儿使用头孢菌素类药物都会出现副作用，且具体副作用的发生情况因个体差异而异。在使用头孢菌素类药物时，医生会根据患儿的具体情况权衡利弊，并密切观察患儿的反应。如果出现副作用，应及时告知医生，以便采取相应的处理措施。同时，家长也应注意观察患儿的情况，如有异常应及时就医。