苯丙酮尿症需要长期治疗，何时可以停药取决于多种因素，通常需要在医生的指导下进行监测和评估。
苯丙酮尿症是一种遗传代谢性疾病，由于苯丙氨酸羟化酶基因突变导致苯丙氨酸代谢障碍，使苯丙氨酸及其代谢产物在体内蓄积，引起一系列神经系统损害。
治疗方法主要是饮食治疗，即限制苯丙氨酸的摄入。患儿需要食用低苯丙氨酸的特殊配方奶粉或食物，以保证体内苯丙氨酸的浓度维持在正常范围内。
治疗的原因是苯丙氨酸是人体必需的氨基酸之一，但对于苯丙酮尿症患者来说，过量的苯丙氨酸会对神经系统造成损害。通过饮食控制，可以减少苯丙氨酸的摄入，避免神经系统损伤。
治疗过程中，需要定期监测血苯丙氨酸浓度，以调整饮食方案。同时，还需要进行生长发育评估、智力评估等，以确保治疗效果。
一般来说，患儿需要终身治疗，但在治疗过程中，医生会根据患儿的具体情况逐渐调整饮食，可能会在一段时间后允许适当增加苯丙氨酸的摄入量。在医生认为患儿的病情稳定、神经系统发育正常后，可能会考虑逐渐减少饮食限制或停药。
需要注意的是，苯丙酮尿症的治疗需要严格遵循医生的建议，不能自行调整饮食或停药。同时，定期的随访和监测也非常重要，以便及时发现问题并采取相应的措施。
总之，苯丙酮尿症的治疗是一个长期的过程，停药需要在医生的指导下进行，以确保患儿的健康和安全。