孕囊偏小有胎心胎芽可能是以下原因导致的：
1.受孕时间较晚：如果月经周期不规律或排卵较晚，孕囊可能会比实际孕周小，但仍能看到胎心胎芽。
2.胎儿发育正常：虽然孕囊偏小，但胎儿的发育情况良好，胎心胎芽正常，这种情况通常不需要特殊处理，只需定期复查。
3.胎停育：孕囊偏小且没有胎心胎芽，可能是胎停育的表现，需要进一步检查确认。
4.其他因素：孕妇的年龄、身体状况、孕囊的位置等也可能会影响孕囊的大小和发育情况。
需要注意的是，孕囊偏小并不一定意味着胎儿存在问题，但需要密切关注胎儿的发育情况，及时进行产前检查和咨询医生的建议。如果有任何异常情况，应及时采取相应的措施。