眼睛里面长小水泡可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的治疗方法：
1.过敏性结膜炎：如果是由于过敏引起的，可以使用抗组胺药或肥大细胞稳定剂来缓解症状。如果症状严重，可以使用糖皮质激素眼药水。
2.感染性结膜炎：需要使用抗生素眼药水或眼膏来治疗。如果是病毒感染引起的，可能需要使用抗病毒眼药水。
3.睑裂斑：一般不需要治疗，如果影响美观或引起不适，可以考虑手术切除。
4.结膜结石：如果结石较小，没有症状，可以不处理。如果结石较大，或引起眼部不适，可以在表面麻醉下用针头剔除。
5.其他原因：如泡性结膜炎、淋巴管阻塞等，也可能导致眼睛里面长小水泡，需要根据具体情况进行治疗。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案应根据病因、病情严重程度以及患者的个体情况而定。如果眼睛里面长小水泡持续不愈或伴有其他症状，建议及时就医，进行详细的眼部检查和诊断，以便制定合适的治疗方案。
对于儿童、孕妇、哺乳期妇女以及患有其他疾病的人群，治疗方法可能会有所不同，需要在医生的指导下进行治疗。同时，在使用眼药水时，应注意正确的使用方法和频率，避免过度使用或使用不当导致不良反应。
此外，保持良好的眼部卫生习惯，避免揉眼、过度用眼，避免接触过敏原等，也有助于预防眼部疾病的发生和复发。