一般来说，月经持续时间为2-8天，平均4-6天。因此，月经来三天就干净了可能是正常的，但也可能提示存在一些问题。以下是一些可能的原因：
1.正常变异：每个人的月经周期和持续时间都可能有所不同。有些女性的月经可能比较短暂，只要月经量正常，身体没有其他不适，这可能是个体差异导致的正常现象。
2.月经量较少：如果月经总量较少，即使持续时间较短，也可能导致月经在三天内干净。月经量的多少受到多种因素的影响，如子宫内膜的厚度、激素水平等。
3.生活方式和环境因素：生活方式的改变，如压力、剧烈运动、饮食不规律、过度节食或肥胖、环境变化等，都可能影响月经周期和持续时间。
4.疾病因素：某些健康问题也可能导致月经异常，如子宫内膜异位症、子宫肌瘤、多囊卵巢综合征、甲状腺功能异常等。这些疾病可能影响子宫内膜的正常生长和脱落，导致月经不规律或缩短。
5.药物影响：某些药物，如避孕药、某些抗生素或抗抑郁药等，可能对月经产生影响，包括缩短月经持续时间。
需要注意的是，如果月经周期明显缩短、出血量异常或伴有其他不适症状，如痛经、经前期综合征、性交疼痛等，应及时就医进行详细的检查和评估。医生会进行详细的病史询问、体格检查，并可能建议进行一些辅助检查，如超声、激素测定等，以确定具体原因。
此外，保持健康的生活方式对于维持正常的月经周期也很重要。这包括均衡饮食、适量运动、减少压力、规律作息等。如果对月经问题有任何疑虑或担忧，最好咨询医生的建议，以便获得个性化的指导和进一步的处理。