连花清瘟胶囊和阿莫西林胶囊可以一起吃，但需要在医生的指导下使用。
连花清瘟胶囊是一种中药，主要成分包括连翘、金银花、炙麻黄、炒苦杏仁、石膏、板蓝根、绵马贯众、鱼腥草、广藿香、大黄、红景天、薄荷脑、甘草等，具有清瘟解毒、宣肺泄热的功效，主要用于治疗流行性感冒属热毒袭肺证，症见发热、恶寒、肌肉酸痛、鼻塞流涕、咳嗽、头痛、咽干咽痛、舌偏红、苔黄或黄腻等。
阿莫西林胶囊是一种抗生素，主要成分是阿莫西林，适用于敏感菌（不产β内酰胺酶菌株）所致的各种感染，如呼吸道感染、泌尿生殖道感染、皮肤软组织感染等。
两种药物的成分没有明显的冲突，一起服用可能会增强治疗效果。但需要注意的是，连花清瘟胶囊是一种中药，服用时需要注意以下几点：
1.避免同时服用滋补性中药。
2.风寒感冒者不适用。
3.高血压、心脏病患者慎用。
4.肝功能不全者慎用。
5.孕妇及哺乳期妇女慎用。
阿莫西林胶囊是一种抗生素，服用时需要注意以下几点：
1.对青霉素过敏者禁用。
2.传染性单核细胞增多症患者慎用。
3.用药前必须详细询问药物过敏史并进行青霉素皮肤试验。
4.阿莫西林可导致采用Benedict或Fehling试剂的尿糖试验出现假阳性。
5.下列情况应慎用：①有哮喘、枯草热等过敏性疾病史者。②老年人和肾功能严重损害时可能需调整剂量。
总之，连花清瘟胶囊和阿莫西林胶囊可以一起吃，但需要在医生的指导下使用，避免自行用药。同时，在服用药物期间，应注意饮食清淡，避免食用辛辣、油腻、生冷等刺激性食物，多喝水，注意休息。如果出现不适症状，应及时就医。